Les vitraux des ateliers Bégule, naissent, selon les cas, de collaborations diverses : les esquisses peuvent être d'Eugène Grasset ou de Charles Lebayle mais aussi de Tony Tollet à la chapelle du Sacré-Coeur, ou de Jacquesson de la Chevreuse à Saint-Nizier, mais encore d'Irénée Richard ou d'Emile Delalande et Gaspard Poncet à Caluire. Ils sont inspirés, selon le style de l'édifice qu'ils éclairent, de la typologie de verrières anciennes : vitrail néo-roman dans une église néo-romane comme celle du Bon Pasteur, grande verrière néogothique dans le chapelle néogothique Saint-Martin-d'Ainay ou verrière de style néo-Renaissance dans telle ou telle chapelle de ce même style. Les vitraux sont exécutés, sous l'autorité de Lucien Bégule, par le personnel des ateliers avec toute la fluctuation que cela implique et toutes les possibilités de traitement de grisaille, d'émaillage et de travail sur le verre qui appartiennent à chacun.Cependant, les vitraux crées dans les ateliers Lucien Bégule, tout en suivant une véritable évolution entre 1881 et 1911, portent les signes d'une maturation dans la technique de l'art du vitrail, vers une expression claire, lumineuse et de plus en plus décorative tout en restant en parfaite adéquation avec l'édifice, public ou privé, civil ou religieux, qu'ils éclairent.